Svartsjön är ett naturreservat som ligger i Haninge kommun i Stockholms Län. Reservatet skapades den 11:e augusti 2011 och är förvaltat av Länsstyrelsen i Stockholms län. Svartsjön är 36 hektar stort och består av 28 hektar landyta, 7 hektar vatten och 4 hektar skog.
Reservatet har en mångfald av naturmiljöer som inkluderar hällmarker, gammelskogar och myrar. De två sjöarna Svartsjön och Långsjön finns också i området. Svartsjön är en naturlig sjö som är cirka 5 meter djup och har klart vatten som är populärt för fiske. Långsjön är en mindre sjö som är grundare och har mer näringsrikt vatten.
Svartsjön har en rik flora och fauna med många olika arter av växter och djur. I området finns bland annat älg, rådjur och vildsvin. Fågellivet är också rikt med bland annat fiskgjuse, ormvråk och spillkråka.
Reservatet är öppet för allmänheten och det finns flera vandringsleder som leder besökarna genom de olika naturmiljöerna. Svartsjön är ett populärt utflyktsmål och är ett viktigt område för friluftslivet i Haninge kommun.