Svanträsk är en plats med en varierande natur. Här finns tre sjöar, varav den största är cirka 25 hektar. Det finns också torra lavklädda skogsmarker, frodiga och rent av sumpiga blötskogar samt stora myrmarker. I norr ligger den största sjön, Svanaträsket, och längs dess västra kant står blandsumpskog av tall, björk och gran med riklig underväxt av gräs, starr och örter. Efter bäcken söder om Svanaträsket står sumpskog, där björk, gran och tall omväxlande dominerar. Vissa partier har även inslag av gamla sälgar. På många granar i anslutning till bäcken växer ringlav, en lavart som i nordligaste Sverige främst förekommer i orörda bäckskogar.
Reservatets naturvärden är knutna till mångfalden av miljöer och skogar med lång kontinuitet. Området hyser naturskogsarter som dvärgbägarlav, kortskaftad ärgspik och doftticka, vilka visar på skogar med höga naturvärden och stor variation. Hackspettarna spillkråka och tretåig hackspett är också typiska arter i äldre barrskogar och kan observeras i området.
Svanträsk är ett viktigt naturreservat i Norrbottens län och är ett exempel på bevarad natur med höga naturvärden som är knutna till skogar med lång kontinuitet.
