Området är mycket kuperat och består av en mosaik av skogar, myrar och vattendrag mellan fjällbjörksklädda lågfjäll. Mer än hälften av området täcks av barrskog, framför allt granurskog. Den högsta toppen i området är Bårgå, som når 856 meter över havet.
En unik egenskap hos Ståkke-Bårgå fjällurskog är den glesa skogen av lågväxta men mycket grova tallar i reservatets norra del. Skogen är uppemot 400 år gammal och det mesta är helt orört. Detta område är också känt för sina tjugotal olika vegetationstyper, varav det flacka området sydost om Harrok har något som närmast kan kallas tallskogstundra.
Reservatet har en skogsareal på 4598 hektar och är ett viktigt område för bevarande av fjällnära skog. Det är också hem åt flera hotade arter, däribland fjällräv, fjällpipare och fjällabb. Ståkke-Bårgå fjällurskog är ett populärt område för friluftsliv, vandring och fiske under sommarmånaderna.