Södra Lunsen är ett vackert naturreservat beläget i nordvästra delen av Knivsta kommun i Uppsala län. Det relativt nya naturreservatet skapades den 1 januari 2021 och förvaltas av Länsstyrelsen i Uppsala län. Med en storlek på 112 hektar består reservatet av 112 hektar landyta, varav 97 hektar är skog.
Reservatet är småkuperat och består av hällmarker med en härlig vildmarkskänsla. I skogen finns det luckiga områden med solbelysta tallar och aspar, fuktiga löv- och granskogspartier och naturliga rastplatser. Upplandsleden går igenom området och knyter ihop det med det kommunala naturreservatet Norra Lunsen i norr.
Majoriteten av Södra Lunsen karaktäriseras av längsgående låga bergsryggar klädda med hällmarker med små fattigkärr i dalarna. Tall är det dominerande trädslaget i området. Terrängen blir mer flack mot norr och sydväst och delvis sumpigare. I söder övergår hällmarkstallskogen gradvis till granskog och i norr ung lövrikblandskog.
Reservatet har en rik flora och fauna med flera intressanta arter. Besökare kan bland annat stöta på brödtaggsvamp, motaggsvamp och rynkskinn.
Södra Lunsen är lättillgängligt från flera närbelägna tätorter via Upplandsleden och är en populär plats för friluftsliv. Med sin vackra natur och varierande terräng är det en perfekt plats för en avkopplande promenad eller en spännande vandring.