Ruthagsskogen är ett naturreservat beläget i kommunen Heby i Uppsala län. Reservatet har förvaltats av Länsstyrelsen i Uppsala län sedan det skapades den 21 januari 1993 och omfattar en landyta på 97 hektar.
Reservatet består till stor del av gammal tallskog och myrmarker, vilket skapar en vildmarkskänsla mitt i Uppland. Här råder stor tystnad, där endast naturens ljud hörs. Det finns gott om lingon och blåbär, och om man har tur kan man även hitta hjortron ute på Evighetsmossen.
Ruthagsskogen är varierande, med mjukt kuperade hällmarker med ståtliga tallar avlösta av våta myrmarker med dvärgbjörkar, pors, tuvull och andra fuktälskande arter. De flesta tallarna är runt 250 år gamla och har växt upp efter en skogsbrand som härjade i området i början av 1700-talet.
När man vandrar runt i skogen händer det att man hör hastiga vingslag när man skrämt upp en tjäder eller att det brakar till när en älg försvinner ur ens väg. Man kan också höra en ivrigt trummande hackspett eller spillkråkans ensliga rop. Här är det djuren och naturen som regerar, inte människan!
Reservatet har två anordningar - information och parkering. Ruthagsskogen och Evighetsmossen uppmärksammades redan under 1940-talet som kärnan i ett av Upplands sista vildmarksområden. Anledningen till att området har blivit naturreservat är att det har lämnats att utvecklas i fred för människor.