Det mest kännetecknande för Mörtträskheden är de gamla tall- och barrskogarna som finns här. Stora delar av området består av sandig hed men det finns också inslag av hällmarker och en mosaik av skog och våtmark i västra delen. Tallskogen och barrblandskogen i området är mestadels runt 200 år gamla med inslag av tallar som är ännu äldre, upp till 400 år.
I området finns också gott om stående döda träd vilket ger en speciell karaktär åt skogen. De gamla tallarna bär spår av skogsbränder, så kallade brandljud, som inträffade för mer än 250 år sedan. Det finns också nyare skog som har vuxit upp efter branden och är därför ungefär 200 år gammal.
Östra delen av området domineras av tallskog på sandig hed med smala fuktstråk som är fyllda av enbuskar, gräs och örter vilket ger en speciell kontrast till den i övrigt magra tallheden. Mörtträskheden är en plats att besöka för naturskönhet och för att uppleva den vackra och unika skogskaraktären.
