Krakhultabäcken är ett naturreservat som ligger i Jönköping, Jönköpings län. Det förvaltas av Länsstyrelsen i Jönköpings län och skapades den 26 juli 2013. Reservatet är 9 hektar stort och består helt av landyta, varav 8 hektar utgörs av skog.
Det som gör Krakhultabäcken speciellt är dess vattendrag i form av strömmande vatten. Bäcken mynnar ut i Nissan och anses vara en viktig reproduktionslokal för öringen. Området är utpekat som nationellt särskilt värdefullt med avseende på natur och fiske.
För besökare finns en informationsanordning i reservatet där man kan lära sig mer om dess betydelse och värde. Krakhultabäcken är en plats för fridfull naturupplevelse och att upptäcka dess biologiska mångfald.