Komosse södra är ett naturreservat beläget i Jönköping, Jönköpings Län. Reservatet förvaltas av Länsstyrelsen i Jönköpings län och skapades den 18 oktober 2003. Med en storlek på 347 hektar består Komosse södra huvudsakligen av landyta, inklusive 94 hektar skog.
Reservatet innehåller tre mossar - Bohestramossen, Johansjömossen och Fiskerydsmossen - som ligger vid gränsen mellan Västergötland och Småland. Mossarna är till största delen skoglösa, men mindre områden är glest trädbevuxna. Det glesa trädskiktet finns ofta vid kärr, vattendrag och fastmark.
Större mossgölar finns koncentrerade till ett område på södra delen av Johansjömossen. En mindre del av myrmarken består av laggkärr och dråg. Tidigare användes de mer produktiva kärren till hötäkt. Vissa dråg växer successivt till bäckar som omges av kärrmader. Ett fint exempel på detta är Kilabäcken på Johansjömossen.
Ute i myrmarken ligger några större fastmarksholmar med barrskog. Väster om Fiskerydsmossen finns ett större område med sumpskog och kärrstråk. Besökare kan ta del av information om reservatet på platsen.