Huvudskär är ett naturreservat som ligger i Haninge kommun i Stockholms län. Det förvaltas av Skärgårdsstiftelsen i Stockholms län och skapades redan den 8 april 1974. Naturreservatet täcker en stor yta om 2076 hektar, varav 80 hektar är land och 1995 hektar är vatten.
Naturreservatet är hem till ett rikt fågelliv med många häckande sjöfågelarter som ejder, svärta, tobisgrissla, labb, skrak och vigg. Dessutom finns det olika arter av vitfågel som bor i reservatet. Tordmule kan också ses häcka i angränsande områden.
Huvudskär är ett vackert naturområde som är väl värt ett besök. Här kan man uppleva naturens skönhet och få chansen att se många olika fågelarter i dess naturliga miljö.
