Utanför bältena av knappag finns örtrika kärr dominerade av halvgräset axag. Här återfinns flera typiska källkärrsväxter och många olika orkidéer. Mot skogskanten övergår vegetationen till fuktäng. Även här är vegetationen mycket örtrik med rika förekomster av orkidéer som ängsnycklar, luktsporre och kärrknipprot.
Myren omges på tre sidor av gles och mager tallskog med inslag av gran, ek och oxel. Skogen är överlag luckig och uppvisar tecken på tidigare betesprägel. Här och var finns små hällmarks- och våtmarksområden insprängda, vilket skapar en fin mosaikstruktur med rikligt med brynmiljöer. Särskilt hällmarkerna är mycket fina och uppvisar höga naturvärden.
Trots att Hoburgsmyr är botaniskt intressant kan upplevelsen förtas av närheten till ett av Gotlands största kalkstensbrott. Det finns information att tillgå i naturreservatet.