Haparanda-Sandskär är ett naturreservat som ligger i kommunen Haparanda, Norrbottens län. Reservatet förvaltas av Länsstyrelsen i Norrbottens län och skapades den 8 oktober 1983. Det omfattar en total yta på 998 hektar, varav 33 hektar är landyta och 964 hektar är vatten.
Naturreservatet ligger i Malifjärden och gränsar till nationalparken Haparanda skärgård. Två öar ingår i reservatet, Letto och Ylikari. Här finns en mångfald av olika typer av naturtyper, från öppna klippor och sandstränder till tät skog och vassområden.
Reservatet är hem för många olika arter av både växter och djur. Här finns flera hotade fågelarter, som t.ex. tretåig mås och skärsnäppa, och det är också ett viktigt område för sjöfågel. Bland däggdjuren som lever i området finns säl, utter och hare.
Besökare kan njuta av vacker natur, vandra längs markerade leder och paddla i det kristallklara vattnet. På öarna finns även möjlighet att tälta och övernatta. Haparanda-Sandskär är ett viktigt område för naturbevarande och är en viktig del av Norrbottens unika skärgårdsmiljö.