Flotthöljan är ett naturreservat beläget i Gävleborgs län, i kommunen Hudiksvall. Reservatet är 108 hektar stort och skapades den 1 april 1997. Det förvaltas av Länsstyrelsen i Gävleborgs län.
Av de 108 hektar som utgör reservatet är 99 hektar landyta och 9 hektar vatten. Skogen täcker 77 hektar av området. Inom reservatet finns även anordningar såsom informationsskyltar, parkeringsplatser och rastplatser.
Ett av de främsta dragen i Flotthöljan är Svåga älv som delar sig i grunda forsar och omges av långsmala öar. En promenad längs stigen vid älvens sydvästra strand bjuder på fina naturupplevelser. Skogen intill älven är hem åt ringlaven - en av landets mer sällsynta barrskogslavar. Den växer på stammar och grenar av tall, gran och björk, och många granar är vackert klädda av laven. I den fuktiga miljön och det karakteristiska klimatet i närheten av älvens forsar trivs ringlaven och olika mossor.
Naturreservatet är också hem åt hotade mossarter såsom liten hornflikmossa, kurragömmamossa och alsidenmossa. Bland områdets vedsvampar kan nämnas ullticka, rynkskinn, doftskinn och rosenticka.
Flotthöljan är en idealisk plats för den som vill uppleva naturen och dess mångfald av liv.